现承担国家、省、市各类科研课题180多项，年外来到位科研经费超千万元。建有国家水稻K优117等原原种繁育基地、国家大宗蔬菜产业技术体系温州综合试验站、国家水稻南方区试温州试验站、中国绿色碳汇基金会碳汇研究院等科研平台，拥有1个省级重点实验室——浙江省浙南作物育种重点实验室；3个市级重点实验室——温州市农产品质量安全重点实验室、温州市设施蔬菜工程技术研究中心、温州市海产品加工工程技术研究中心；1个博士后流动站分站、1个院士工作站。

现设有中国绿色碳汇基金会碳汇技术培训基地、浙江省现代农业技术培训基地、浙江小企业创业基地、温州市农村干部与农民培训中心、温州农民学院、温州市大学生“村官”创业与研究基地、温州青年创业学院、温州市大学生现代农业创业园、温州市退役士兵培训基地、温州市职业技能提升培训基地等多个国家、省、市级教育培训平台，年培训学员近万人次。设有南京农业大学在职研究生教学点、北京理工大学、北京语言大学、浙江农林大学、浙江工商大学、浙江理工大学等远程教育和成人专升本学历教育教学点，目前在读成人学历教育学员1000多人。

 温州科技职业学院是由温州市人民政府举办，经浙江省人民政府批准、国家教育部备案的公办普通高等职业学院。凡完成规定课程经考核合格或修完规定学分，颁发温州科技职业学院印鉴的全国普通高等教育专科（高职）学历证书，国家电子注册。

学校设立涵盖农林牧渔、食品药品与粮食、财经商贸、电子信息、装备制造、水利、土木建筑、资源环境与安全、旅游等九个专业大类27个专业，全日制在校生8200余人。