食品生物技术专业在进行充分市场调研的基础上，于2004年开始招生，并建立食品专业实验室，现基本可以完成焙烤食品生产技术、乳品生产技术、肉品生产技术的90%以上的实验，并向学生全面开放实验室，培养学生自主创业意识。在校外也相继建立了“益得乳制品实验厂”、“内蒙古红鼎食品有限公司”、“初林食品有限公司”、“内蒙古双汇食品有限公司”、“内蒙古盛谷酿造食品有限公司”等实习实训基地，还联系敕勒川酒业、哈尔滨汇鑫源食品有限公司、蒙牛集团、伊利集团等作为学生综合实习实训的场所。
培养目标：培养掌握基础化学、食品化学、食品工艺学、食品营养与食品安全的基本知识、基本技能，能在食品领域内从事食品生产、食品营养、食品安全、品质控制等方面的应用型高级技术人才。
食品生物技术专业课程设置与国家职业资格证书相结合，实行双证融合，学生毕业时，通过考核可获得“食品检验工”、“营养配餐师”、“烘焙工”、“公共营养师”等专业技能证书职业资格证书。食品生物技术专业开设的主要课程：食品化学、食品营养学、食品检测技术、乳品生产技术、焙烤食品生产技术、肉与肉制品工艺学、食品微生物学、高等数学、大学英语、基础化学、食品工程原理、机械制图、食品生物技术、发酵食品生产技术、饮料工艺学、食品添加剂、功能性食品学、食品营销学、食品生物动态、大学生心理健康教育等.
毕业去向: (1)就业：食品生物技术专业培养具备食品营养与食品安全的基本知识和技能，能在食品企业、商检、卫生防疫等领域，从事食品生产、食品营养、食品安全有关的技术、管理及教学等相关工作的应用型高级技术人才。就业部门包括全国各级食品卫生监督部门；食品企业的生产、管理部门；食品企业的安全质量控制和管理部门；社区营养与食品安全服务部门；餐饮业的营养配餐部门等。 (2)自主创业：以向学生全面开放实验室的方式鼓励学生自主创业，从原料的采购、生产、销售、经营全部由学生自己负责，教师指导。培养学生创业意识与创业渴望，锻炼学生适应社会的能力。