2017年荣昌校区机制体制改革文件出台，西南大学下发了《西南大学荣昌校区办学体制改革方案》，《方案》进一步明确了荣昌校区的定位，指出荣昌校区是学校办学体系的重要组成部分，是集多年办学传统和荣昌区独特的区位优势，以动物学科为主要特色、多学科协调发展、产学研紧密结合、服务地方经济社会发展、培养高素质应用型人才的高水平特色校区，《方案》指出，西南大学荣昌校区办学以普通本科教育为主，积极发展专业学位为主的研究生教育，适当发展网络继续教育。通过改造、新增等方式实现校区专业结构优化，形成以“动物科学、动物医学、水产养殖和畜牧物流、贸易为主线，信息技术为手段”的本科专业格局，实现与本部差异化发展。标志着学校深化荣昌校区办学体制机制改革翻开新的一页，荣昌校区教育事业开启了新的征。